Behandlingen avhenger av hvilken type anorektal misdannelse som foreligger.
Hvis det er en synlig åpning (fistel) hvor det kommer ut mekonium (den første, svarte avføringen til barnet), vil det oftest være tilstrekkelig å utvide denne åpningen med et instrument. Det kalles dilatasjonsbehandling. Da brukes pinner (Hegar stifter) med forskjellig tykkelse for å utvide åpningen. Dette kan gjøres uten narkose. Så snart barnet kvitterer avføring, kan ammingen starte. Foreldrene lærer å vedlikeholde størrelsen på fistelåpningen ved å sette inn Hegarstifter i fistelåpningen daglig.
Oftest er det nødvendig med en operasjon hvor man flytter fistelen til det stedet hvor endetarmen normalt skulle vært. Denne operasjonen skjer gjerne ved 2-3 mnd alder. Avhengig av plassering av fistelen, gjøres en liten operasjon (analplastikk eller mini-PSARP), eller et større inngrep (PSARP).
Hvis det ikke er noen synlig fistelåpning, må barnet få utlagt tarm (stomi) i løpet av de første levedøgn. Ved 2-3 mnd alder gjøres PSARP operasjon. Da konstrueres en endetarmsåpning i sentrum av lukkemuskelen. Noen uker etter at dette er gjort, vil stomien lukkes, og barnet kan tømme avføring via endetarmen. Disse operasjonene foregår i narkose.
Gjør det vondt ?
Operasjoner foretas i narkose, etter operasjonen gis smertestillende medisiner som barnet vanligvis har god effekt av.
Hvor lenge varer behandlingen?
Hvis det i nyfødtperioden er tilstrekkelig å blokke fistelen, kan barnet vanligvis reise hjem eller overflyttes til lokal barneavdeling etter noen dager. Det avhenger blant annet av om barnet har andre misdannelser.
Hvis barnet får stomi, må det være ved barnekirurgisk avdeling til man ser at avføringen kommer greit ut i posen. Dette skjer vanligvis i løpet av underkant av en uke. Foreldrene må også lære stell av den utlagte tarmen (stomistell). Dette kan eventuelt skje på lokalt sykehus.
Ved operasjonen hvor man skal lage en ny endetarmsåpning, varierer det hvor omfattende inngrepet er. Når det gjøres et større inngrep (PSARP), vil barnet vanligvis ligge i avdelingen i underkant av en uke. Når den utlagte tarmen skal lukkes noen uker senere, ligger gjerne barnet i avdelingen en snau uke.